Qual é a diferença entre 16s rRNA e 18s RRNA?
Qual é a diferença entre 16s rRNA e 18s RRNA?

Vídeo: Qual é a diferença entre 16s rRNA e 18s RRNA?

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Vídeo: What Is 16s rRNA sequencing? 2024, Novembro
Anonim

O principal diferença entre realizando análises com 18S rRNA dados do gene em vez de 16S rRNA Os dados do gene (ou dados ITS) são o banco de dados de referência usado para a coleta de OTU, as atribuições taxonômicas e a construção de alinhamento baseada em modelo, uma vez que deve conter sequências eucarióticas.

Considerando isso, por que o gene 16s rRNA é usado para identificação?

o Gene 16S de RNA ribossômico codifica o componente de RNA da subunidade 30S do ribossomo bacteriano. Devido à complexidade da hibridização DNA-DNA, Gene 16S rRNA sequenciamento é usado como uma ferramenta para identificar bactérias no nível de espécie e auxiliam na diferenciação entre espécies bacterianas intimamente relacionadas [8].

Além disso, os eucariotos têm rRNA 16s? o 16S rRNA gene está presente em todas as bactérias, e uma forma relacionada ocorre em todas as células, incluindo as de eucariotos.

Também a questão é: o que é rRNA 18s e 28s?

o 28S / RNA ribossômico 18S A razão é freqüentemente usada para avaliar a qualidade do RNA total purificado de qualquer amostra. Em humanos, 28S rRNA tem ~ 5070 nucleotídeos e 18S tem 1869 nucleotídeos, o que dá um 28S / 18S proporção de ~ 2,7. Um alto 28S / 18S proporção é uma indicação de que o RNA purificado está intacto e não se degradou.

O que é sequenciamento de rRNA 16s?

16S rRNA gene seqüência a análise é um método padrão na taxonomia e identificação bacteriana, e é baseada na detecção de seqüência diferenças (polimorfismos) nas regiões hipervariáveis do 16S rRNA gene que está presente em todas as bactérias.

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